Open MPI安装使用

Open MPI是非常流行的免费MPI环境，主页是：https://www.open-mpi.org，选择合适的版本下载安装。

以下以2.0.2版为例。

1. 下载：

   wget https://www.open-mpi.org/software/ompi/v2.0/downloads/openmpi-2.0.2.tar.bz2

2. 解压缩：

   tar xvf openmpi-2.0.2.tar.bz2

3. 进入解压缩后的openmpi-2.0.2目录

   cd openmpi-2.0.2

4. 查看配置帮助
   • 查看说明

     more README

   • 查看安装帮助

     more INSTALL

   • 显示configure的可配置选项

     ./configure --help| less

5. 运行configure配置脚本（下面以Intel编译器为例，并且已经设置好Intel编译环境）

   CC=icc CXX=icpc FC=ifort ./configure --prefix=/opt/openmpi/2.0.2/intel/2017.0.098

   • CC：设定编译C源文件时的编译命令
   • CXX：设定编译C++源文件时的编译命令
   • FC：设定编译Fortran源文件时的编译命令
   • --prefix：设定安装后的目录
   配置过程中，请注意错误提示，或者查看config.log文件。
6. 编译

   make

7. 安装（如--prefix指定的目录非当前用户可写，那么需要root权限将其安装在那个目录）

   make install

8. 设定环境变量

   可以设置在自己的环境变量中自己使用，也可以设置到系统环境中供全部用户使用

   • Bash：
     • 全部用户：/etc/profile、/etc/bash.bashrc、/etc/profile.d/openmpi.sh
     • 个人用户：~/.bashrc
   • Csh：
     • 全部用户：/etc/csh.cshrc、/etc/profile.d/openmpi.csh
     • 个人用户：~/.cshrc

   Bash或Csh的环境设置内容：

   • Bash环境设置：

     OPENMPI=/opt/openmpi/2.0.2/intel/2017.0.098
     PATH=$OPENMPI/bin:$PATH
     LD_LIBRARY_PATH=$OPENMPI/lib:$LD_LIBRARY_PATH
     INCLUDE=$OPENMPI/include:$INCLUDE
     CPATH=$OPENMPI/include:$CPATH
     MANPATH=$OPENMPI/share/man:$MANPATH
     

   • Csh环境设置：

     set OPENMPI=/opt/openmpi/2.0.2/intel/2017.0.098
     setenv PATH $OPENMPI/bin:$path
     setenv LD_LIBRARY_PATH $OPENMPI/lib:$LD_LIBRARY_PATH
     setenv INCLUDE $OPENMPI/include:$INCLUDE
     setenv CPATH $OPENMPI/include:$CPATH
     setenv MANPATH $OPENMPI/share/man:$MANPATH
     

9. 设置后重新登录即可生效，或者手动使其生效

   source 设置所在文件

10. 查看是否设置正确

    which mpirun

    如果显示/opt/openmpi/2.0.2/intel/2017.0.098/bin/mpirun，则表明正确
11. 基本用法
    • 设置使用16个进程运行MPI程序/path/mpiapp

      mpirun -n 16 /path/mpiapp